El Govern ha aprovat la constitució del Govern Territorial de Salut de l'Alt Empordà i n'ha aprovat els seus Estatuts. Les seves funcions bàsiques que inclouen, com a mínim, atenció primària, hospitalària i sociosanitària, són l'ordenació i la coordinació dels recursos per garantir la millor prestació dels serveis sanitaris. Els Governs Territorials de Salut tenen com a objectiu prioritari incrementar la participació del món local en la direcció i la gestió del sistema sanitari, creant un marc de col·laboració entre l'Administració de la Generalitat i els ens locals en matèria de planificació i prevenció de la salut.
De fet, aquests consorcis donen veu als ajuntaments en la política nacional de salut i per això tenen una composició equilibrada que garanteix la paritat en l'adopció de decisions entre els membres designats per les entitats locals i els designats pel Govern.
La creació d'aquests consorcis és un pas més en la descentralització del sistema sanitari català, que té previst formalitzar un total de 37 Governs Territorials. Amb aquest, ja són 34 els ens constituïts.
El Govern Territorial de l'Alt Empordà comprèn una població de 135.942 habitants. En formen part els municipis d'Agullana, d'Albanyà, d'Albons, de l'Armentera, d'Avinyonet de Puigventós, de Bàscara, de Bellcaire d'Empordà, de Biure, de Borrassà, de Cabanelles, de Cabanes, de Cadaquès, de Cantallops, de Capmany, de Castelló d'Empúries, de la Cistella, de Colera, de l'Escala, d'Espolla, del Far de l'Empordà, de Figueres, de Fortià, de Garrigàs, La Jonquera, de Lladó, de Llançà, de Llers, de Masarac, de Navata, d'Ordis, de Palau de Santa Eulàlia, de Palau-Saverdera, Ajuntament de Pau, Pedret i Marzà, de Peralada, de Pont de Molins, de Portbou, de Rabós, de Riumors, de Roses, de Sant Climent Sescebes, de Sant Llorenç de la Muga, de Sant Miquel de Fluvià, de Sant Pere Pescador, de Santa Llogaia d'Àlguema, de Saus, Camallera i Llampaies, de La Selva de Mar, de Siurana, de Terrades, de Torroella de Fluvià, de Ventalló, de Viladamat, de Vilademuls, de Vilafant, de Vilamacolum, de Vilamalla, de Vilamaniscle, de Vila-Sacra, de Vilaür, de Vilopriu, i el Consell Comarcal de l'Alt Empordà.
