Segons Puig, aquest acord no s'hauria d'haver subscrit mai, perquè "atempta contra la memòria històrica de Catalunya" i s'ha subscrit amb tres comunitats autònomes, que "no han retirat els recursos contra l'Estatut de Catalunya, que van presentar amb motiu d'aquests articles específics sobre l'arxiu".
Per a Puig, que el govern català hagi subscrit aquest acord amb tres comunitats autònomes amb litigis pendents contra l'Estatut, "ha estat un error, ja que si els recursos prosperen els fons passaran a mans del Patronat, perdent-los Catalunya."
Puig ha assenyalat que l'arxiu compta amb majoria de fons públics de la Generalitat de Catalunya i la majoria dels elements que formen part de l'Arxiu pertanyen també al nostre país, però amb tot i això, "l'acord subordina la Generalitat de Catalunya a un patronat en el qual té poca representació i amb Presidència de la Ministra de Cultura del Govern de l'Estat".
Segons Felip Puig, aquest acord respon al "clar procés de desnacionalització" que estan portant a terme els socialistes a Catalunya, i ha lamentat la "renúncia al projecte de país" per part d'ERC, que "manté el silenci". En aquest sentit, ha recordat que ERC no formava part del Govern de la Generalitat quan es va signar aquest acord, però ha denunciat que els republicans "tampoc ara que hi tornen a formar part, no diguin ni piú".