Durant el procés de restauració del campanar i de la façana de l'església, els arquitectes han detectat alguns deficiències en l'interior de la nau que fins i tot incidien en la seguretat dels visitants del temple. L'església va rebre una neteja parcial als anys 60 que ha deixat algunes de les parets a mig emblanquir i es pot apreciar una línia que separa la pedra emblanquida d'aquella més fosca. Segons ha explicat el conseller de Política Territorial i Obres Públiques, Joaquim Nadal, també hi ha escletxes per on s'escola la llum i, quan plou, l'aigua, hi ha salts en la volta, alguns capitells estan malmesos i els nervis de la volta gòtica també presenten desperfectes.
Per arreglar-ho, s'ha començat a muntar una bastida a la part posterior de l'església del terra fins a dalt de la volta per fer una neteja de les parets –amb un procediment de projecció d'aigua a pressió i amb raig de pols de silicat d'alumini humit-, es pretén eliminar les sals de la volta, es farà un repicat de morters de les untes del carreus dels paraments i de les voltes, s'unirà la volta amb el mur perimetral per fer-la més estable i segura, les peces de pedra deteriorada en canviaran per noves i també es restauraran les columnes, capitells i arcs.
Per dur a terme aquesta actuació, s'hi destinen 441.382 euros, dels quals 60.000 són aportats per la Diputació i l'Ajuntament de Girona i la resta pel DPTOP. Les obres tenen un període d'execució de sis mesos però el conseller Nadal ha afirmat que per les festes de Sant Narcís la bastida ja s'haurà retirat i 'el més gros' de l'obra estarà acabat. 'Així amb totes garanties es podrà celebrar la missa solemne en honor a Sant Narcís', ha assegurat Nadal.
En els darrers anys, s'han fet dos projectes a l'església que han estat per rehabilitar tant la façana com el campanar. Després d'aquesta darrera intervenció, que complementa el ja fet fins ara, només quedarà pendent la millora de la capella barroca de Sant Narcís, afectada per humitats. Aquesta capella té les parets de marbre i la humitat les ha malmès visiblement. També està pendent d'executar-se un projecte per il·luminar la nau central del temple.
Afectacions al culte
El rector de Sant Feliu, mossèn Pere Domènech, ha explicat que les afectacions al cultes seran mínimes. Segons ha indicat, la missa diària –a la que assisteixen una dotzena de fidels- es celebrarà a la capell del Cor de Maria. Mossèn Domènech ha explicat que si cal celebrar algun enterrament entre setmana ja s'ha acordat amb l'empresa que netejaran el temple i pararan la feina.
Durant els caps de setmana, l'empresa també s'encarregarà de deixar el temple en condicions perquè s'hi pugin fer casaments o batejos.
