El seu objectiu principal és unir l'esforç de totes les associacions federades per col·laborar en la millora de la qualitat de vida de les persones que pateixen aquestes malalties, així com de les seves famílies. És amb aquesta voluntat que es vetllarà pel desenvolupament de les següents accions, contemplades als estatuts de la Federació:
-Unificar de criteris d'informació, difusió i conscienciació al voltant d'aquestes malalties.
-Crear de programes unitaris d'actuació
-Crear d'un òrgan de relació amb les institucions catalanes
-Establir relacions amb les federacions de la resta de l'Estat amb la finalitat de crear una confederació
-Col·laborar en el foment de la investigació
La Federació d'Associacions de Fibromiàlgia i Síndrome de fatiga crònica de Catalunya està formada per 14 associacions:
AFIMIR (Montcada i Reixac), AFIMOIC (Mollet i Vallès Oriental), BAAF (Badalona), AFGA (Gavà), AVAF (Viladecans), AFIMAT (Mataró i Maresme), AFIBROCAT (Barcelona), AAFYSFC (Sta. Coloma de Gramenet), La Xarxa Solidària (Reus), La Xarxa Solidària (Cambrils), La Xarxa Solidària (Valls), AOAF (Osona), APAFI (Palau de Plegamans), Lalliga (lliga reumatològica i dèficits Motrius Crònics).