L'Agència Catalana de l'Aigua (ACA) ha informat que, de moment, l'embassament de La Baells segueix éssent l'únic de Catalunya amb presència de musclo zebrat. Aquest mol·lusc és una espècie invasora que es va detectar en aquest pantà el 2011 i que, a partir de llavors, s'ha anat estudiant i controlant per evitar-ne la seva possible expansió. 

Segons l'ACA, els darrers mostrejos que s'han realitzat a 17 punts de control durant la primavera i l'inici de la tardor no han detectar la presència d'aquest musclo als pantans de Sau, Susqueda, el Pasteral, Boadella, la Llosa del Cavall, Sant Ponç, Foix, Gaià, Siurana, Riudecanyes, Santa Fe i Vallforner, així com tampoc a la reclosa del Cairat, l'estany de Banyoles, les basses de recàrrega de Sant Vicenç dels Horts i la reclosa de Molins de Rei. 

El control del musclo zebrat a Catalunya és important, ja que es tracta d'una espècie gairebé impossible d'eradicar als llocs ja colonitzats. Concretament, la presència d'aquest mol·lusc no suposa cap alteració en la qualitat de l'aigua destinada al subministrament, tot i que des del punt de vista socioeconòmic pot afectar les infraestructures de les preses. En el cas de La Baells, aquesta espècie invasora pot provocar danys a les instal·lacions de captació, canalització i emmagatzematge d'aigua, així com als mecanismes, reixes i filtres, que poden quedar obstruïts per l'acumulació dels bivalbs. 

Els principals afectats, per tant, poden ser el sector energètic de producció hidroelèctirca, el turístic i el d'abastament d'aigua potable i de reg. A nivell ecològic, a més, el mol·lusc pot afectar l'hàbitat i l'ecosistema del pantà per la seva ocupació física i l'elevada capacitat filtradora.